于2023年11月23日收到; 2024年3月7日接受;于2024年3月26日发表作者分支:1生物学与生物技术系,意大利帕维亚大学,意大利帕维亚大学; 2 MRC全球传染病分析中心,英国伦敦帝国学院; 3英国欣克斯顿的欧洲生物信息学研究所欧洲分子生物学实验室; 4 Microbiology和病毒学单元,Fondazione Irccs Policlinico San Matteo,意大利帕维亚; 5英国巴斯大学生命科学系米尔纳进化中心; 6 Fondazione Irccs Policlinico San Matteo,意大利帕维亚。*信函:John A. Lees,Jlees@ebi。Ac。UKUK关键字:AMR;抗生素抗性;细菌基因组学; gwas;肺炎;机器学习;麦克风缩写:AMR,抗菌耐药性; BACC,平衡精度; CI,一致性指数; CPFX,环丙沙星; ES,效果大小; fn,假否定; Gen,庆大霉素; GTR,一般时间可逆; GWAS,基因组广泛的关联研究; LD,连锁不平衡; MAF,次要等位基因频率; MEM,MeropeNem; MIC,最小抑制浓度; SNP,单核苷酸多态性; TP,真正的积极; TZP,哌拉西林/tazobactam; WGS,整个基因组测序。数据语句:文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用二十四个支持数据和一个补充表。001222©2024作者
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